同样，《阴符经》在中国古代的哲学、政治学、兵学中也都占居相当高的地位，对百家学说皆有深远影响。
然从黄老思想体系的形成与发展来看，《阴符经》的价值，更体现在以下几个方面：
1）理论根基
黄老思想，发端于伏羲神明文化，发展于炎黄精神文化，大成于老子道德文化。伏羲之学通神明之德，类万物之情，重在天人相应，感而遂通；黄帝之学继而演化为以人为本，天人合一的生命体证；而老子之学，则以羲黄道统为根柢，进一步释放出道法自然、清静无为的生命智慧，使中华文脉得以薪火相传。
概言黄老之学，一言以蔽之，曰“长生久视”之道。此道最重“深根固蒂”。根者，天性也。蒂者，身命也。故“长生久视”者，实为性命之学、天人之道。一部《阴符经》，三篇三百字，篇篇不离天道，句句示人阴符，天人合一之道尽在此经，且上承《易经》，下启《道德经》，在阐述“观天执天”思想的同时，亦提出“天道”、“自然”、“阴阳”等道统理论的基本要素。此后，无论是黄老学说还是诸子百家，皆以天道、自然、阴阳理论为源头活水，滋养其学说之根蒂。
2）修真首经
构成黄老思想根基的经典，主要是《河图》《洛书》、《易经》、《阴符经》、《道德经》等。《河图》《洛书》以数字包孕大道至理，《易经》以爻象演绎阴阳法则，唯《阴符经》与《道德经》总述河洛易理，妙传性命之学。且《阴符经》堪称《道德经》之纲要，是真正首传黄老道学的经典文献。
从后世所传承的修真体系看，虽然演化出不同的内丹学派，但顺应天道、自然、阴阳法则而内炼精气神，即“神仙抱一”而炼神还虚、“富国安民”而炼气化神、“强兵战胜”而炼精化气，则一直是修炼主流。
此外，从历代圣贤修真体悟来看，《阴符经》的地位亦是如此。如吕洞宾说的“天仙大道备是经矣”、张伯端说的“尽从此处达真诠”、吕坤说的“《易传》、《道德》、《清静》三经皆从此出”、闵小艮说的“诚为修道之玄范”、刘一明说的“古今来修道第一部真经”等等，尽属“过来人”之大实话。
3）行为法则
《阴符经》上中下三篇，实为“内合天机，外合人事”之三大行为法则。
上篇，天道法则。
天道，即一气周行之道，含阴阳造化，五行妙理。经曰：“立天之道，以定人也”，以天定人，即是教人出世入世谨和一气周行，顺应一气运化，握其机，乘其机，进而天人合一而忘其机，自然成就阴符之功、载物之德。此天道玄机，全在阳生，或可直言，天道即阳生之道。谙此道者，人之天与自然之天内外交感，天之性与人之命浑然为一，即可谓合天道、应天时，自是“得道多助”。《易》曰：“易无思也，无为也”，然无不思也，无不为也。修真，就是通天之道，秉天之德，得天之助，与天合一。所谓抬头三尺有神明，天道之谓也。
中篇，自然法则。
自然，即道的先天自性，自然而然。此自然，乃阴阳之根，造化之本，静而育生机，动而含杀机，静机动机，全在“五贼”顺生与逆克之自然运化。经曰：“天生天杀，道之理也”。少阳之气升（木气）而滋生万物，少阴之气降（金气）而肃杀万物。人能解天之生杀道理以为修炼，则无杀我之害而得生我之功。人生而静，天之性也。感物而动，性之欲也。若物至而不知止，好恶无绝于内，物诱于外而不返躬，是谓灭天理，灭天理而穷人欲者，是人被物盗而昏然不觉，真大乱之道也。阴符，即以自然之性，契自然之理，照之以心，契之以机，身不动而精化气，心不动而气化神，意不动而神还虚，返本还元总不离自然至静之道。此即人法自性，自然之则。《道德经》曰：“道之尊，德之贵，夫莫之命而常自然”。《清静经》曰：“内观其心，心无其心；外观其形，形无其形；远观其物，物无其物”，能三者既无，不受天地万物之盗，三才安稳，身若太虚，心归无极，何虑道之不成。
下篇，阴阳法则。
阴阳，即道由隐而显，“非常道”，“非常名”，是虚无一气的内在机制，天地万物的盈虚消息。阴阳或曰有无，或曰天地，或曰日月，或曰四时，或曰鬼神，或曰水火，总是同出而异名，既是世间万物的运行动力，又是生命化育的不竭之源。阴阳之大，大至二重天地，即形而上之天地与形而下之天地。形而上者，先天虚无，空灵妙用。形而下者，后天实有，时空器用。先天阴阳乾坤定位，乃阴阳之根本；后天阴阳坎离执中，乃阴阳之性命。经曰：“生者，死之根。死者，生之根”，此即阴阳互根之理，意在警示世人，须遵“道丧而死自来，道在而生自图”的法则，不可于生、于身爱厚而大过，于死、于事甚恶而不明。所谓“沉水入火，自取灭亡”，亦是教修真之人，须洞悉天地与自身真阴真阳，四时之行不离阴阳之道，效法圣人以中自居，方能死生在我。若悖此理，必如沉水自溺，投火自焚。张果曰：“理国以道，在于损其事而已；理军以权，在于亡其兵而已。无死机则不死，鬼神其如我何？无生机则不生，天地其如我何？”由此概言阴阳，实为道、法、术之通则。《道德经》曰：“人法地，地法天，天法道，道法自然”，如是者，以自身阴阳合于天地阴阳，方为“天人合一”、“圣人抱一”。此阴阳要义不可违也。
二、《阴符经》的本体观
黄老思想作为华夏民族的根文化，立足于天人合一的大生命观，尽言深根固蒂、长生久视之道，自然会以对生命终极关怀的视角来认知万物本原及存在根据。《易经·系辞》曰：“形而上者谓之道，形而下者谓之器”，《阴符经》的本体观所展现的，正是这个形而下的世界的形而上的根据。
1、自然之道
《阴符经》以“自然之道”为宇宙万物的本原与存在根据。
其一，“自然之道静，故天地万物生。”
自然之道至静无为，然动静皆得其性，无为而无不为。静之至，不知所以生也，天地万物却皆由此生。这是对道家本体观“无极而太极”的经典概括，与《易经》“易有太极，是生两仪”一脉相承。
易之于太极，即老子所谓“道生一”。对此，老子深度解读说：“有物混成，先天地生。寂兮寥兮，独立而不改，周行而不殆，可以为天下母。吾不知其名，字之曰道，强名之为大。”按老子之说，道有三个特征：一是先天地生；二是独立而不改，周行而不殆；三是可以为天下母。如此，完全满足了解决万物本原与存在依据问题的基本条件。因其是先天的，独立的，初始的，故其运行自然而然，为天地万物所法，而其本身则始终保持自性“独立而不改，周行而不殆”，故老子曰“道法自然”。自然者，自性使然也。
其二，“天生天杀，道之理也。”
世间万象，存在与消亡，皆缘自“自然之道”的自然之理，且“圣人知自然之道不可违”，只能“因而制之”。此道如同万物春生夏长、秋收冬藏，生于天而杀于天。亦“如人得天之灵明而成人，复死于天之灵明而成鬼”，“惟天之道而内有理存焉”，“能究此理，则得天道矣”（清·石和阳）。此天道，即“天地以阴阳之气化万物，万物不知其盗；万物以美恶之味飨人，人不知其盗；人以利害之谋制万物，万物不知其盗。三盗玄合于人心，三才顺动于天理”（唐·张果）。此天理至简至易，顺天生者，人归本元，随真阳之气生发复升，内合天机，至道生真，遁隐在世而圣机内明，以此外通天地，自然生生不息。若为人悖逆天道，不知天理，不知进退，无明而错认根本，任意而损伤神气，常此害物害人，损不足以奉有余，必然自减天数，自毁根基，难逃天杀。是此，明阴符之妙者，当尊天地自然之位，顺阴阳化育之机，因自然而冥之，利自然而用之，不违自然之道且能裁制变通，自然得与天地同功用。
